Jérémie Belpois découvre un supercalculateur dans une usine abandonnée et y trouve une jeune fille virtuelle en danger. Avec l'aide de ses amis Ulrich, Odd, et Yumi, ils explorent le monde virtuel de Lyoko et fait face à des attaques étranges. Ensemble, ils découvrent que la remise en route du Supercalculateur a également réveillé XANA, un puissant programme informatique malveillant. Déterminés à libérer Aelita de sa prison virtuelle, les nouveaux amis jurent de continuer à lutter contre XANA et de garder leur découverte secrète.
